昆明医科大学公共卫生学院前身为筹建于1978年的昆明医学院卫生系，早在1956年昆明医学院独立建院时即 成立了公共卫生学教研组。1979年卫生学专业招生，1989年由卫生系更名为昆明医学院预防医学系，2001年撤系组建公共卫生学院。 　　公共卫生学院设有流行病与卫生统计学系、环境卫生与职业医学系、营养与食品科学系、社区卫生系、儿少与妇幼卫生系、卫生事业管理与卫生经济系、卫生检验与检疫系等7个教学系，设有预防医学实验中心、预防医学培训中心、云南省全科医学培训中心等3个实验和社会服务中心，设有昆明医科大学健康研究所、昆明医科大学食品与营养研究所等2个研究所和党政办、学生办、教学办、学科科研与研究生办等4个管理办公室。 　　中国共产党昆明医科大学公共卫生学院委员会下设3个教师党支部、3个本科生党支部和2个研究生党支部。学院设有工会委员会、共青团委员会等群团组织，工会下设4个工会小组，团委下设21个团支部。 　　学院拥有一支治学严谨、责任感强、专业知识扎实、教学特色鲜明、科研和国际交流与合作能力强，有很强团结协作精神和年富力强的教学团队。现有在编教师83人，教授12人，副高级职称28人，中级职称36人;有博士学位22人，硕士学位51人。有博士生导师7人(其中院外导师4人);硕士生导师29人，另有外单位遴选的硕士生导师25人。学院有云南省中青年学科技术带头人2名，昆明市中青年学术技术带头人2人，省级教学名师1人，云南省高等学校教学科研带头人1人。 　　83名教师中，有中共党员63人(占75.9%);有民主党派人士5人。

　　基础医学院集教学、科研及学生管理为一体，其前身即基础医学部，成立于1987年底，2000年改建为基础医学院。现有物理数学、化学、遗传与细胞生物学、人体解剖学、组织胚胎学、病理学、寄生虫学、微生物与免疫学、生理学、病理生理学、生物化学、药理学十二个教研室。以及机能、形态学及分子生物学三个实验室;有解剖学、病理学、寄生虫学、生理学、病理生理学、生物化学和药理学等七个硕士授予点及相应的研究室，设有院办公室及学生工作办公室。 　　学院现有教职工198人，其中教授18人，副教授46人，具有博、硕士学位教师39人，全国优秀教师3名，省级有突出贡献优秀专业技术人才及省级优秀教师6名。 　　学院在确保全院本科临床医学、口腔、药学、预防、法医、检验、麻醉、护理等各专业教学任务的同时，还承担其它二级学院各专业研究生及成教、高职教、自考等不同层次学生的大量教学任务。开设必修课40余门，选修课10余门。